Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbx2P48031 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms