Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms