Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl6P47911 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl6P47911 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms