Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capza1P47753 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Capza1P47753 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms