Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms