Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx3P42581 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx3P42581 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx3P42581 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx3P42581 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmx3P42581 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmx3P42581 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hmx3P42581 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmx3P42581 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmx3P42581 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmx3P42581 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmx3P42581 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmx3P42581 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmx3P42581 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmx3P42581 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmx3P42581 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms