Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VhlP40338 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VhlP40338 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VhlP40338 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VhlP40338 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VhlP40338 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
VhlP40338 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VhlP40338 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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