Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf2P39429 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms