Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col18a1P39061 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col18a1P39061 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col18a1P39061 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col18a1P39061 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col18a1P39061 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col18a1P39061 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms