Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rfc1P35601 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rfc1P35601 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rfc1P35601 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rfc1P35601 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rfc1P35601 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rfc1P35601 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rfc1P35601 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rfc1P35601 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms