Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab5cP35278 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab5cP35278 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab5cP35278 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab5cP35278 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rab5cP35278 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rab5cP35278 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab5cP35278 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rab5cP35278 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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