Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms