Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stfa3P35173 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stfa3P35173 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms