Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp4P35123 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp4P35123 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp4P35123 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms