Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms