Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa2P31245 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms