Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnnd1P30999 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms