Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VtnP29788 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VtnP29788 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VtnP29788 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VtnP29788 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VtnP29788 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms