Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp1P29452 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp1P29452 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp1P29452 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms