Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif5cP28738 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms