Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BgnP28653 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BgnP28653 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BgnP28653 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BgnP28653 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BgnP28653 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BgnP28653 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BgnP28653 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BgnP28653 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms