Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms