Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LoxP28301 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LoxP28301 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LoxP28301 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LoxP28301 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LoxP28301 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LoxP28301 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LoxP28301 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LoxP28301 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LoxP28301 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LoxP28301 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LoxP28301 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 562 ms