Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CebpbP28033 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CebpbP28033 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CebpbP28033 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms