Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xrcc5P27641 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Xrcc5P27641 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Xrcc5P27641 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Xrcc5P27641 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Xrcc5P27641 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Xrcc5P27641 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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