Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChgaP26339 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgaP26339 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChgaP26339 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms