Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd247P24161 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd247P24161 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.5 ms