Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18528 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18528 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18528 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18528 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
P18528 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18528 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18528 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18528 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P18528 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P18528 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P18528 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P18528 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P18528 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms