Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb1P17919 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms