Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms