Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb1P12658 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb1P12658 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms