Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P10404 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P10404 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P10404 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P10404 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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