Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms