Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem254bP0DN90 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms