Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Amd1P0DMN7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms