Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf3P09920 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csf3P09920 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms