Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb7P09024 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb7P09024 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb7P09024 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb7P09024 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb7P09024 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb7P09024 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb7P09024 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb7P09024 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.8 ms