Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa4P06728 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms