Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-Eb1P04230 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-Eb1P04230 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms