Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col4a1P02463 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms