Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01746 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01746 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01746 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01746 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01746 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01746 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms