Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01663 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01663 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01663 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01663 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01663 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01663 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01663 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01663 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms