Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01662 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01662 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01662 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01662 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01662 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01662 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01662 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01662 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms