Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01661 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01661 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01661 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01661 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01661 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01661 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01661 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01661 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01661 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms