Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcn2O88968 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcn2O88968 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms