Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CntfrO88507 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CntfrO88507 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfrO88507 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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