Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxq1O70220 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxq1O70220 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms