Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg2O55111 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms