Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngr2O55101 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms