Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LatO54957 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LatO54957 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LatO54957 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LatO54957 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LatO54957 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LatO54957 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LatO54957 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LatO54957 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LatO54957 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LatO54957 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LatO54957 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LatO54957 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LatO54957 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms